Tsirigos, A.: шукати на сайті Z-Library

Martinez-Outschoorn, Ubaldo E., Prisco, Marco, Ertel, Adam, Tsirigos, Aristotelis, Lin, Zhao, Pavlides, Stephanos, Wang, Chengwang, Flomenberg, Neal, Knudsen, Erik S., Howell, Anthony, Pestell, Richar

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 938 KB

english, 2001

Ketones and lactate increase cancer cell “stemness,” driving recurrence, metastasis and poor clinical outcome in breast cancer

Журнал:

Bonuccelli, Gloria, Tsirigos, Aristotelis, Whitaker-Menezes, Diana, Pavlides, Stephanos, Pestell, Richard G., Chiavarina, Barbara, Frank, Philippe G., Flomenberg, Neal, Howell, Anthony, Martinez-Outsc

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.86 MB

english, 2011

Ketones and lactate “fuel” tumor growth and metastasis

Журнал:

Tamposis, Ioannis A, Tsirigos, Konstantinos D, Theodoropoulou, Margarita C, Kontou, Panagiota I, Bagos, Pantelis G, Hancock, John

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.14 MB

english, 2010

Semi-supervised learning of Hidden Markov Models for biological sequence analysis

Журнал:

Almagro Armenteros, José Juan, Tsirigos, Konstantinos D., Sønderby, Casper Kaae, Petersen, Thomas Nordahl, Winther, Ole, Brunak, Søren, von Heijne, Gunnar, Nielsen, Henrik

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.11 MB

english, 2018

SignalP 5.0 improves signal peptide predictions using deep neural networks

Журнал:

Nature Biotechnology

Рік:

2019

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.40 MB

english, 2019

Accurate phylogenetic classification of variable-length DNA fragments

McHardy, Alice Carolyn, Martín, Héctor García, Tsirigos, Aristotelis, Hugenholtz, Philip, Rigoutsos, Isidore

Журнал:

Nature Methods

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 324 KB

english, 2006

A conserved activation element in BMP signaling during Drosophila development

Weiss, Alexander, Charbonnier, Enrica, Ellertsdóttir, Elín, Tsirigos, Aristotelis, Wolf, Christian, Schuh, Reinhard, Pyrowolakis, George, Affolter, Markus

Журнал:

Nature Structural and Molecular Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.47 MB

english, 2009

Genetic inactivation of the polycomb repressive complex 2 in T cell acute lymphoblastic leukemia

Ntziachristos, Panagiotis, Tsirigos, Aristotelis, Vlierberghe, Pieter Van, Nedjic, Jelena, Trimarchi, Thomas, Flaherty, Maria Sol, Ferres-Marco, Dolors, da Ros, Vanina, Tang, Zuojian, Siegle, Jasmin

Журнал:

Nature Medicine

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 16.76 MB

english, 2012

A guideline to proteome-wide α-helical membrane protein topology predictions

Konstantinos D. Tsirigos, Aron Hennerdal, Lukas Käll, Arne Elofsson

Журнал:

PROTEOMICS

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 921 KB

english, 2012

OMiR: Identification of associations between OMIM diseases and microRNAs

Simona Rossi, Aristotelis Tsirigos, Antonio Amoroso, Nicoletta Mascellani, Isidore Rigoutsos, George A. Calin, Stefano Volinia

Журнал:

Genomics

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 301 KB

english, 2011

Multipath routing in the presence of frequent topological changes

IEEE Communications Magazine

Журнал:

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 874 KB

english, 2001

Mitochondria “fuel” breast cancer metabolism: Fifteen markers of mitochondrial biogenesis label epithelial cancer cells, but are excluded from adjacent stromal cells

Sotgia, Federica, Whitaker-Menezes, Diana, Martinez-Outschoorn, Ubaldo E., Salem, Ahmed F., Tsirigos, Aristotelis, Lamb, Rebecca, Sneddon, Sharon, Hulit, James, Howell, Anthony, Lisanti, Michael P.

Журнал:

Pavlides, Stephanos, Tsirigos, Aristotelis, Migneco, Gemma, Whitaker-Menezes, Diana, Chiavarina, Barbara, Flomenberg, Neal, Frank, Philippe G., Casimiro, Mathew C., Wang, Chenguang, Pestell, Richard G

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.35 MB

english, 2012

The autophagic tumor stroma model of cancer

Журнал:

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.25 MB

english, 2010

GenomicTools: a computational platform for developing high-throughput analytics in genomics

Tsirigos, A., Haiminen, N., Bilal, E., Utro, F.

Журнал:

Bonuccelli, Gloria, Castello-Cros, Remedios, Capozza, Franco, Martinez-Outschoorn, Ubaldo E., Lin, Zhao, Tsirigos, Aristotelis, Xuanmao, Jiao, Whitaker-Menezes, Diana, Howell, Anthony, Lisanti, Michae

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 100 KB

english, 2012

Dynamic changes in the human methylome during differentiation

Laurent, L., Wong, E., Li, G., Huynh, T., Tsirigos, A., Ong, C. T., Low, H. M., Kin Sung, K. W., Rigoutsos, I., Loring, J., Wei, C.-L.

Журнал:

Genome Research

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.62 MB

english, 2010

The milk protein α-casein functions as a tumor suppressor via activation of STAT1 signaling, effectively preventing breast cancer tumor growth and metastasis

Журнал:

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.76 MB

english, 2012

A new computational method for the detection of horizontal gene transfer events

Tsirigos, A.

Журнал:

Bagos, Pantelis G., Tsirigos, Konstantinos D., Liakopoulos, Theodore D., Hamodrakas, Stavros J.

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.66 MB

english, 2005

Prediction of Lipoprotein Signal Peptides in Gram-Positive Bacteria with a Hidden Markov Model

Журнал:

Journal of Proteome Research

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.70 MB

english, 2008

Large Tilts in Transmembrane Helices Can Be Induced during Tertiary Structure Formation

Virkki, Minttu, Boekel, Carolina, Illergård, Kristoffer, Peters, Christoph, Shu, Nanjiang, Tsirigos, Konstantinos D., Elofsson, Arne, von Heijne, Gunnar, Nilsson, IngMarie

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.61 MB

english, 2014

Contrasting roles of histone 3 lysine 27 demethylases in acute lymphoblastic leukaemia

Ntziachristos, Panagiotis, Tsirigos, Aristotelis, Welstead, G. Grant, Trimarchi, Thomas, Bakogianni, Sofia, Xu, Luyao, Loizou, Evangelia, Holmfeldt, Linda, Strikoudis, Alexandros, King, Bryan, Mullend

Журнал:

Nature

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.03 MB

english, 2014

Molecular profiling of a lethal tumor microenvironment, as defined by stromal caveolin-1 status in breast cancers

Witkiewicz, Agnieszka K., Kline, Jessica, Queenan, Maria, Brody, Jonathan R., Tsirigos, Aristotelis, Bilal, Erhan, Pavlides, Stephanos, Ertel, Adam, Sotgia, Federica, Lisanti, Michael P

Журнал:

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.11 MB

english, 2011

SOX2 is a cancer-specific regulator of tumour initiating potential in cutaneous squamous cell carcinoma

Siegle, Jasmin M., Basin, Alice, Sastre-Perona, Ana, Yonekubo, Yoshiya, Brown, Jessie, Sennett, Rachel, Rendl, Michael, Tsirigos, Aristotelis, Carucci, John A., Schober, Markus

Журнал:

Nature Communications

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.65 MB

english, 2014

Analysis of Multipath Routing—Part I: The Effect on the Packet Delivery Ratio

IEEE Transactions on Wireless Communications

Журнал:

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 317 KB

english, 2004

Analysis of Multipath Routing, Part 2: Mitigation of the Effects of Frequently Changing Network Topologies

IEEE Transactions on Wireless Communications

Журнал:

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 613 KB

english, 2004

Combinatorial Modulation of Signaling Pathways Reveals Cell-Type-Specific Requirements for Highly Efficient and Synchronous iPSC Reprogramming

Vidal, Simon E., Amlani, Bhishma, Chen, Taotao, Tsirigos, Aristotelis, Stadtfeld, Matthias

Журнал:

Stem Cell Reports

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.13 MB

english, 2014

Loss of stromal caveolin-1 leads to oxidative stress, mimics hypoxia and drives inflammation in the tumor microenvironment, conferring the “reverse Warburg effect”: A transcriptional informatics analysis with validation

Pavlides, Stephanos, Tsirigos, Aristotelis, Vera, Iset, Flomenberg, Neal, Frank, Philippe G., Casimiro, Mathew C., Wang, Chenguang, Fortina, Paolo, Addya, Sankar, Pestell, Richard G., Martinez-Outscho

Журнал:

LITOU, ZOI I., BAGOS, PANTELIS G., TSIRIGOS, KONSTANTINOS D., LIAKOPOULOS, THEODORE D., HAMODRAKAS, STAVROS J.

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.16 MB

english, 2010

PREDICTION OF CELL WALL SORTING SIGNALS IN GRAM-POSITIVE BACTERIA WITH A HIDDEN MARKOV MODEL: APPLICATION TO COMPLETE GENOMES

Журнал:

Journal of Bioinformatics and Computational Biology

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 782 KB

english, 2008

Is cancer a metabolic rebellion against host aging? In the quest for immortality, tumor cells try to save themselves by boosting mitochondrial metabolism

Ertel, Adam, Tsirigos, Aristotelis, Whitaker-Menezes, Diana, Birbe, Ruth, Pavlides, Stephanos, Martinez-Outschoorn, Ubaldo E., Pestell, Richard G., Howell, Anthony, Sotgia, Federica, Lisanti, Michael

Журнал:

Proceedings of the National Academy of Sciences

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.77 MB

english, 2012

Anterior-posterior positional information in the absence of a strong Bicoid gradient

Ochoa-Espinosa, A., Yu, D., Tsirigos, A., Struffi, P., Small, S.

Журнал:

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.22 MB

english, 2009

Glycolytic cancer associated fibroblasts promote breast cancer tumor growth, without a measurable increase in angiogenesis: Evidence for stromal-epithelial metabolic coupling

Migneco, Gemma, Whitaker-Menezes, Diana, Chiavarina, Barbara, Castello-Cros, Remedios, Pavlides, Stephanos, Pestell, Richard G., Fatatis, Alessandro, Flomenberg, Neal, Tsirigos, Aristotelis, Howell, A

Журнал:

Tsaousis, G. N., Tsirigos, K. D., Andrianou, X. D., Liakopoulos, T. D., Bagos, P. G., Hamodrakas, S. J.

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.05 MB

english, 2010

ExTopoDB: a database of experimentally derived topological models of transmembrane proteins

Журнал:

Proceedings of the National Academy of Sciences

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 124 KB

english, 2010

Short blocks from the noncoding parts of the human genome have instances within nearly all known genes and relate to biological processes

Rigoutsos, I., Huynh, T., Miranda, K., Tsirigos, A., McHardy, A., Platt, D.

Журнал:

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.26 MB

english, 2006

Understanding the "lethal" drivers of tumor-stroma co-evolution

Lisanti, Michael P., Martinez-Outschoorn, Ubaldo E., Chiavarina, Barbara, Pavlides, Stephanos, Whitaker-Menezes, Diana, Tsirigos, Aristotelis, Witkiewicz, Agnieszka K., Lin, Zhao, Balliet, Renee M., H

Журнал:

Cancer Biology & Therapy

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.43 MB

english, 2010

CXCL12-Producing Vascular Endothelial Niches Control Acute T Cell Leukemia Maintenance

Pitt, Lauren A., Tikhonova, Anastasia N., Hu, Hai, Trimarchi, Thomas, King, Bryan, Gong, Yixiao, Sanchez-Martin, Marta, Tsirigos, Aris, Littman, Dan R., Ferrando, Adolfo A., Morrison, Sean J., Fooksma

Журнал:

Cancer Cell

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.22 MB

english, 2015

OMPdb: a database of -barrel outer membrane proteins from Gram-negative bacteria

Tsirigos, K. D., Bagos, P. G., Hamodrakas, S. J.

Журнал:

Tsirigos, Aristotelis, Rigoutsos, Isidore, Stormo, Gary D.

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.30 MB

english, 2011

Alu and B1 Repeats Have Been Selectively Retained in the Upstream and Intronic Regions of Genes of Specific Functional Classes

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 390 KB

english, 2009

Combined prediction of Tat and Sec signal peptides with hidden Markov models

Bagos, P. G., Nikolaou, E. P., Liakopoulos, T. D., Tsirigos, K. D.

Журнал:

Martinez-Outschoorn, Ubaldo E., Whitaker-Menezes, Diana, Pavlides, Stephanos, Chiavarina, Barbara, Bonuccelli, Gloria, Trimmer, Casey, Tsirigos, Aristotelis, Migneco, Gemma, Witkiewicz, Agnieszka K.,

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 223 KB

english, 2010

The autophagic tumor stroma model of cancer or “battery-operated tumor growth”

Журнал:

Protein Engineering Design and Selection

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.09 MB

english, 2010

Prediction of signal peptides in archaea

Bagos, P.G., Tsirigos, K.D., Plessas, S.K., Liakopoulos, T.D., Hamodrakas, S.J.

Журнал:

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 368 KB

english, 2008

Hyperactivation of oxidative mitochondrial metabolism in epithelial cancer cells in situ

Whitaker-Menezes, Diana, Martinez-Outschoorn, Ubaldo E., Flomenberg, Neal, Birbe, Ruth, Witkiewicz, Agnieszka K., Howell, Anthony, Pavlides, Stephanos, Tsirigos, Aristotelis, Ertel, Adam, Pestell, Ric

Журнал:

Peters, Christoph, Tsirigos, Konstantinos D., Shu, Nanjiang, Elofsson, Arne

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 8.40 MB

english, 2011

Cohesin loss alters adult hematopoietic stem cell homeostasis, leading to myeloproliferative neoplasms

J. Mullenders, B. Aranda-orgilles, P. Lhoumaud, M. Keller, J. Pae, K. Wang, C. Kayembe, P. P. Rocha, R. Raviram, Y. Gong, P. K. Premsrirut, A. Tsirigos, R. Bonneau, J. A. Skok, L. Cimmino, D. Hoehn, I

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.36 MB

english, 2015

Improved topology prediction using the terminal hydrophobic helices rule.

Журнал:

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 237 KB

english, 2015

A sensitive, support-vector-machine method for the detection of horizontal gene transfers in viral, archaeal and bacterial genomes

Tsirigos, A.

Журнал:

Tsirigos, A., Rigoutsos, I.

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.15 MB

english, 2005

Human and mouse introns are linked to the same processes and functions through each genome's most frequent non-conserved motifs

Журнал:

Tsirigos, Konstantinos D., Peters, Christoph, Shu, Nanjiang, Käll, Lukas, Elofsson, Arne

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.00 MB

english, 2008

The TOPCONS web server for consensus prediction of membrane protein topology and signal peptides

Журнал: